磷是一种在土壤中很难移动，且在土壤中的有效性极低微生物肥料。通过微生物的作用，可以提高磷的有效性，促进根系对磷元素的吸收利用。
微生物促进磷有效化的一个重要方面，是对土壤中无机磷的溶解作用微生物肥料。这主要是它们在生命活动中酸的作用结果。
微生物产生的酸，一类是无机酸，如在呼吸作用中产生的碳酸，化能自养细菌产生的NO3-、SO42-等，对这一类酸的作用现已比较明确微生物肥料。
另一类是有机酸微生物肥料。微生物产生的有机酸种类很多，大都有溶磷作用。对这一类物质的研究，已日渐引起重视。
现在已知植物根际微生物对许多不溶性磷酸盐有溶解作用，并已从根际分离出多种溶磷微生物微生物肥料。这些微生物可以产生甲酸、乙酸、丙酸、乳酸、乙醇酸等有机酸，都有溶磷的特性。其中以-羟基酸的反应最顺利。
微生物产生的有机酸中还有葡萄糖酸，对难溶性磷酸盐也有溶解作用微生物肥料。这种酸及一些羟基酸，可与钙、铁等离子构成络合物，从而提高了磷酸盐的溶解度，络合物的稳定性越大，磷酸盐的溶解度越高。
已知形成葡萄糖酸的细菌多系假单胞菌属微生物肥料。这种酸往往在细菌转化糖时形成，对多种矿物有溶解作用，甚至可以溶解难溶的天然磷灰石。
另据对巨大芽孢杆菌等细菌研究的结果，这些细菌产生的有机酸类主要是乳酸和柠檬酸；在土壤中，它们产生葡萄糖酸的量则大于乳酸或乙醇酸微生物肥料。
可以认为微生物在代谢过程中通过呼吸作用分解糖类等碳源，可以产生多种有机酸微生物肥料。这些有机酸在土壤中对无机磷化合物的溶解起着重要作用。
土壤中的磷在很多情况下是无效态的，利用微生物的作用可以促进土壤中磷的有效化过程，提高植物的磷素营养和作物产量，并减少磷肥用量微生物肥料。